Rhodos besitzt drei Häfen: den Mandraki – Hafen bei der Nea Agora, den Emboriko-Hafen sowie den Akadia – Hafen südlich der Altstadt. Mandraki heißt übersetzt "kleiner Schafperch" und eine Erklärung für diesen Namen besagt, dass das mit seiner Bauweise zu tun hat, denn er sieht aus wie eine Zange und umschließt die Schiffe wie der Pferch die Schafherde. Von hier aus können ausländische Segler Tagesausflüge zu den Nachbarninsel Symi, Kos oder Marmaris in der Türkei machen. Besonders schön sind die Segeltörne nach Symi, zur Vulkaninsel Nyssiros und Kos.